logo
Karta przedmiotu
logo

Modelowanie struktur i procesów biologicznych

Podstawowe informacje o zajęciach

Cykl kształcenia: 2022/2023

Nazwa jednostki prowadzącej studia: Wydział Matematyki i Fizyki Stosowanej

Nazwa kierunku studiów: Inżynieria w medycynie

Obszar kształcenia: nauki techniczne

Profil studiów: ogólnoakademicki

Poziom studiów: drugiego stopnia

Forma studiów: stacjonarne

Specjalności na kierunku:

Tytuł otrzymywany po ukończeniu studiów: magister inżynier

Nazwa jednostki prowadzącej zajęcia: Katedra Fizyki i Inżynierii Medycznej

Kod zajęć: 14991

Status zajęć: obowiązkowy dla programu

Układ zajęć w planie studiów: sem: 1 / W15 L15 / 2 ECTS / Z

Język wykładowy: polski

Imię i nazwisko koordynatora: dr inż. Marcin Kowalik

Cel kształcenia i wykaz literatury

Główny cel kształcenia: Celem głównym przedmiotu jest zapoznanie studentów z oprogramowaniem MATLAB w celu modelowania struktur biologicznych.

Ogólne informacje o zajęciach: Kurs składa się z interaktywnego wykładu połączonego z pracą w laboratorium komputerowym. W trakcie zajęć studenci wykonywać będą bezpośrednio zadane problemy inżynierskie obejmujące zagadnienia kierunkowe.

Wykaz literatury, wymaganej do zaliczenia zajęć
Literatura wykorzystywana podczas zajęć wykładowych
1 Mrozek Bogumiła, Zbigniew Mrozek. Matlab i Simulink : poradnik użytkownika Gliwice : Helion. 2018
2 Banasiak, Kazimierz Algorytmizacja i programowanie w Matlabie Wydaw.BTC. 2017
3 Mańczak, Kazimierz. Komputerowa identyfikacja obiektów dynamicznych Warszawa, PWN . 1983
Literatura wykorzystywana podczas zajęć ćwiczeniowych/laboratoryjnych/innych
1 Lubowiecka Izabela MATLAB i jego środowisko Wydaw.Politech.Gdańsk.. 216
2 Lachowicz, Cyprian T. Matlab, Scilab, Maxima : opis i przykłady zastosowań Ofic.Wydaw.Politech.Opol.. 2005
Literatura do samodzielnego studiowania
1 Waldemar Sradomski MATLAB praktyczny podręcznik modelowania Helion. 2015

Wymagania wstępne w kategorii wiedzy/umiejętności/kompetencji społecznych

Wymagania formalne: Spełnia wymogi zawarte w regulaminie studiów.

Wymagania wstępne w kategorii Wiedzy: Ogólna wiedza z informatyki, podstawy algorytmiki oraz podstawowa wiedza z matematyki (funkcje, pochodne, liczby zespolone, rachunek całkowy i różniczkowy)

Wymagania wstępne w kategorii Umiejętności: Znajomość obsługi komputera i systemu MS Windows

Wymagania wstępne w kategorii Kompetencji społecznych: Komunikatywność, umiejętność pracy w grupie.

Efekty kształcenia dla zajęć

MEK Student, który zaliczył zajęcia Formy zajęć/metody dydaktyczne prowadzące do osiągnięcia danego efektu kształcenia Metody weryfikacji każdego z wymienionych efektów kształcenia Związki z KEK Związki z PRK
01 posiada podstawową wiedzę na temat pakietów obliczeniowych wybranego środowiska obliczeniowego laboratorium, wykład obserwacja wykonawstwa K_W04+
P7S_WG
02 Potrafi przedstawić rozwiązanie problemu inżynierskiego w postaci zwięzłego algorytmu, zna podstawowe instrukcje warunkowe, działanie pętli for, while. laboratorium problemowe, wykład interaktywny obserwacja wykonawstwa K_W03+
P7S_WG
P7S_WK
03 Potrafi napisać prosty skrypt (live script) w środowisku Matlab, wie jak sprawdzić jego działanie i zna podstawową obsługę błędów. laboratorium problemowe zaliczenie cz. praktyczna K_U02++
P7S_UW
04 Posiada podstawowe umiejętności stosowania poznanego pakietu do rozwiązywania równań i układów równań, działań na wielomianach, rozwiązywania równań i układów równań różniczkowych i całkowych korzystając z obliczeń wielowątkowych w zastosowaniu biomedycznym laboratorium problemowe obserwacja wykonawstwa K_K03++
P7S_KO
05 Potrafi przygotować, uruchomić i modyfikować skrypty do prezentacji wyników w graficznych z obsługą wykresów 2D i siatek 3D. laboratorium obserwacja wykonawstwa, zaliczenie cz. praktyczna K_U02++
P7S_UW

Uwaga: W zależności od sytuacji epidemicznej, jeżeli nie będzie możliwości weryfikacji osiągniętych efektów uczenia się określonych w programie studiów w sposób stacjonarny w szczególności zaliczenia i egzaminy kończące określone zajęcia będą mogły się odbywać przy użyciu środków komunikacji elektronicznej (w sposób zdalny).

Treści kształcenia dla zajęć

Sem. TK Treści kształcenia Realizowane na MEK
1 TK01 Zapoznanie studentów z kartą przedmiotu i wymaganiami. Prezentacja możliwości środowiska Matlab w zastosowaniach biomedycznych. Wprowadzenie do składni Matlaba, Skrypty i funkcje - struktura kodu, uruchamianie i analiza różnych wariantów obliczeniowych. Zaawansowane konfigurowanie grafiki 2D i 3D - praca z danymi wejściowymi. Przygotowanie skryptów do obliczeń wielowątkowych, analiza czasowa wybranych problemów numerycznych w rozwiązaniach jedno i wielowątkowych L01-L11 MEK01
1 TK02 Kompleksowana analiza wybranych problemów inżynierskich z wykorzystaniem - równań różniczkowych, całkowych, praca z układami równań liniowych i nieliniowych, szybka transformata Fouriera, obliczenia granic i pochodnych funkcji, funkcje jednej i wielu zmiennych, rachunek macierzowy. Tworzenie własnych programów dla zastosowań biomedycznych. L12-L15 MEK01 MEK02 MEK03 MEK04 MEK05
1 TK03 Składowe modeli symulacyjnych, symulacje modeli kości, modelowanie pracy mięśni, modele krwioobiegu, modele dynamiczne układów biologicznych, modelowanie w epidemiologii. W1-W15, L5-15 MEK01 MEK02 MEK03 MEK04 MEK05

Nakład pracy studenta

Forma zajęć Praca przed zajęciami Udział w zajęciach Praca po zajęciach
Wykład (sem. 1) Godziny kontaktowe: 15.00 godz./sem.
Uzupełnienie/studiowanie notatek: 2.00 godz./sem.
Studiowanie zalecanej literatury: 2.00 godz./sem.
Laboratorium (sem. 1) Przygotowanie do laboratorium: 5.00 godz./sem.
Godziny kontaktowe: 15.00 godz./sem.
Konsultacje (sem. 1) Przygotowanie do konsultacji: 2.00 godz./sem.
Udział w konsultacjach: 2.00 godz./sem.
Zaliczenie (sem. 1) Przygotowanie do zaliczenia: 5.00 godz./sem.
Zaliczenie pisemne: 2.00 godz./sem.

Sposób wystawiania ocen składowych zajęć i oceny końcowej

Forma zajęć Sposób wystawiania oceny podsumowującej
Wykład Ocena na podstawie obecności i aktywności na wykładzie.
Laboratorium Na podstawie ocen cząstkowych z zajęć laboratoryjnych (średnia ocen).
Ocena końcowa średnia ocen cząstkowych oraz ocena z zadania podsumowującego.

Przykładowe zadania

Wymagane podczas egzaminu/zaliczenia
(-)

Realizowane podczas zajęć ćwiczeniowych/laboratoryjnych/projektowych
(-)

Inne
(-)

Czy podczas egzaminu/zaliczenia student ma możliwość korzystania z materiałów pomocniczych : nie

Treści zajęć powiazane są z prowadzonymi badaniami naukowymi: tak

1 A. Horzyk; M. Kowalik; J. Starzyk Motivated Agent with Semantic Memory 2023
2 L. Dadiel; Ł. Gondek; C. Jastrzębski; M. Kowalik; S. Kumar Naik; P. Pęczkowski; W. Tabiś; W. Tokarz; P. Zachariasz; J. Żukrowski Iron diffusivity into superconducting YBa2Cu3O7−δ at oxygen-assisted sintering: structural, magnetic, and transport properties 2021