logo
Karta przedmiotu
logo

Struktury danych w medycynie

Podstawowe informacje o zajęciach

Cykl kształcenia: 2022/2023

Nazwa jednostki prowadzącej studia: Wydział Matematyki i Fizyki Stosowanej

Nazwa kierunku studiów: Inżynieria w medycynie

Obszar kształcenia: nauki techniczne

Profil studiów: ogólnoakademicki

Poziom studiów: pierwszego stopnia

Forma studiów: stacjonarne

Specjalności na kierunku:

Tytuł otrzymywany po ukończeniu studiów: inżynier

Nazwa jednostki prowadzącej zajęcia: Zakład Systemów Złożonych

Kod zajęć: 14961

Status zajęć: obowiązkowy dla programu

Układ zajęć w planie studiów: sem: 2 / W15 P15 / 2 ECTS / Z

Język wykładowy: polski

Imię i nazwisko koordynatora: dr inż. Mirosław Mazurek

semestr 2: dr inż. Paweł Dymora

Cel kształcenia i wykaz literatury

Główny cel kształcenia: Zasadniczym celem kształcenia modułu jest prezentacja wybranych zagadnień z zakresu struktur danych w medycynie w kontekście medycznych systemów informatycznych.

Ogólne informacje o zajęciach: Celem modułu jest przekazanie wiedzy z zakresu stosowanych struktur danych we współczesnych informatycznych systemach medycznych. W szczególności w ramach modułu omówione i scharakteryzowane zostaną następujące zagadnienia: charakterystyka elektronicznej dokumentacji medycznej, standard XML, szpitalne bazy danych, problem objętości i kodowania danych medycznych. W szczególności w ramach modułu omówione i scharakteryzowane zostaną struktury danych obrazów medycznych i ich standardy obrazowania i wymiany, cechy danych medycznych i metody ich pozyskiwania. Istotną częścią modułu będzie prezentacja wybranego systemu zarządzania bazą danych - jego architektury i sposobu organizacji w nim bazy danych ukierunkowanej na składowanie i wielowymiarową analizę (z wykorzystaniem języka SQL) danych medycznych.

Materiały dydaktyczne: http://v.prz.edu.pl/pawel.dymora

Wykaz literatury, wymaganej do zaliczenia zajęć
Literatura wykorzystywana podczas zajęć wykładowych
1 Ryszard Tadeusiewicz Informatyka medyczna Wydawnictwo UMCS. 2011
2 Ewa Piętka Zintegrowany system informacyjny w pracy szpitala PWN. 2004
3 Drop B., Furtak-Niczyporuk M. Medyczne systemy elektronicznej wymiany danych w szpitalu Roczniki Kolegium Analiz Ekonomicznych. 2013
4 Jason Price Oracle Database 12c i SQL Helion. 2015
5 Guy Harrison, NoSQL, NewSQL i BigData. Bazy danych następnej generacji Helion. 2018
6 Ramez Elmasri, Shamkant B. Navathe Wprowadzenie do systemów baz danych. Wydanie VII Helion. 2019
7 Dariusz Nabywaniec Anonimizacja i maskowanie danych wrażliwych w przedsiębiorstwach Helion. 2019
Literatura wykorzystywana podczas zajęć ćwiczeniowych/laboratoryjnych/innych
1 Ryszard Tadeusiewicz Informatyka medyczna Wydawnictwo UMCS. 2011
2 Jason Price Oracle Database 12c i SQL Helion. 2015
Literatura do samodzielnego studiowania
1 Michael McLaughlin Oracle Database 12c - Programowanie w języku PL/SQL Helion. 2015

Wymagania wstępne w kategorii wiedzy/umiejętności/kompetencji społecznych

Wymagania formalne: Student powinien mieć wiedzę z zakresu technologii dla telemedycyny oraz podstaw relacyjnych baz danych i składni języka SQL, wykorzystywaną do formułowania i rozwiązywania prostych zadań inżyniers

Wymagania wstępne w kategorii Wiedzy: Ogólna wiedza z zakresu informatyki.

Wymagania wstępne w kategorii Umiejętności: Umiejętność rozwiązywania prostych problemów inżynierskich z zakresu informatyki

Wymagania wstępne w kategorii Kompetencji społecznych: Umiejętność współpracy w grupie

Efekty kształcenia dla zajęć

MEK Student, który zaliczył zajęcia Formy zajęć/metody dydaktyczne prowadzące do osiągnięcia danego efektu kształcenia Metody weryfikacji każdego z wymienionych efektów kształcenia Związki z KEK Związki z PRK
01 Zna i rozumie pojęcia, protokoły i standardy związane z funkcjonowaniem systemów informatycznych w placówkach medycznych. wykład, projekt indywidualny egzamin cz. pisemna, prezentacja projektu K_W09++
K_K05+++
P6S_KK
P6S_KO
P6S_UO
P6S_WG
02 Zna i potrafi wyróżnić podstawowe elementy elektronicznej dokumentacji medycznej. wykład, projekt indywidualny egzamin cz. pisemna, prezentacja projektu K_W11++
K_U18+++
K_K01+++
P6S_KO
P6S_UU
P6S_UW
P6S_WG
03 Zna i świadomie stosuje odpowiednie struktury danych dla wybranych informacji pozyskiwanych w jednostkach medycznych w tym z urządzeń medycznych. wykład, projekt indywidualny egzamin cz. pisemna, prezentacja projektu K_W09+
K_U05++
K_K01+++
P6S_KO
P6S_UO
P6S_UU
P6S_UW
P6S_WG
04 Potrafi dokonać oceny własności medycznych zbiorów danych oraz ich podstawowej analizy statystycznej. wykład interaktywny, projekt indywidualny prezentacja projektu K_W11++
K_U05+++
P6S_UO
P6S_UW
P6S_WG
05 Zna i potrafi wykorzystać dostępne aplikacje i systemy informatyczne w placówkach medycznych. wykład, projekt indywidualny prezentacja projektu K_W09++
K_U18+++
P6S_UW
P6S_WG

Uwaga: W zależności od sytuacji epidemicznej, jeżeli nie będzie możliwości weryfikacji osiągniętych efektów uczenia się określonych w programie studiów w sposób stacjonarny w szczególności zaliczenia i egzaminy kończące określone zajęcia będą mogły się odbywać przy użyciu środków komunikacji elektronicznej (w sposób zdalny).

Treści kształcenia dla zajęć

Sem. TK Treści kształcenia Realizowane na MEK
2 TK01 Zajęcia organizacyjne. Ustalenie formy zaliczenia i zakresu materiału. W01
2 TK02 Charakterystyka informatyki medycznej. Elementy decydujące o odmienności w stosunku do informatyki przemysłowej, informatyki bankowej, itp. Specjalistyczne medyczne bazy danych: charakterystyka medycznej bazy danych, czynności wykonywane w szpitalnej bazie danych, problem objętości medycznych baz danych i kodowanie danych medycznych, bezpieczeństwo medycznej baz danych. W01, W02 MEK01 MEK05
2 TK03 Elektroniczna dokumentacja medyczna: jednostkowe dane osobowe, jednostkowe dane medyczne, aspekty prawne, typy dokumentów medycznych, struktura elektronicznej dokumentacji medycznej, standard XML, elektroniczny rekord medyczny, elektroniczny rekord pacjenta, elektroniczny rekord zdrowotny. W03 MEK01 MEK02 MEK03
2 TK04 Struktury danych obrazów medycznych: współczesne techniki obrazowania medycznego, standard DICOM - obrazowanie cyfrowe i wymiana obrazów w medycynie (ang. Digital Imaging and Communications in Medicine). W04 MEK03 MEK05
2 TK05 Cechy danych medycznych; Metody pozyskiwania danych, jednostki, typy, klasyfikacja i kodowanie danych, normy kliniczne, zalecenia i standardy międzynarodowe, cechy wielowymiarowych zbiorów danych. W05 MEK01 MEK02 MEK03
2 TK06 Badanie własności zbiorów danych: selekcja i ekstrakcja cech, wielowymiarowa analiza danych, statystyczna analiza danych, możliwości języka SQL. W06 MEK04 MEK05
2 TK07 Architektura systemów bazodanowych na przykładzie bazy danych Oracle: struktura serwera baz danych, połączenie z bazą danych, struktura pamięci, procesy pierwszo i drugoplanowe, logiczna i fizyczna struktura danych, przestrzenie tabel, segmenty, extenty i bloki. W07 MEK01 MEK03 MEK05

Nakład pracy studenta

Forma zajęć Praca przed zajęciami Udział w zajęciach Praca po zajęciach
Wykład (sem. 2) Godziny kontaktowe: 15.00 godz./sem.
Projekt/Seminarium (sem. 2) Przygotowanie do zajęć projektowych/seminaryjnych: 5.00 godz./sem.
Godziny kontaktowe: 15.00 godz./sem..
Wykonanie projektu/dokumentacji/raportu: 8.00 godz./sem.
Przygotowanie do prezentacji: 2.00 godz./sem.
Konsultacje (sem. 2) Przygotowanie do konsultacji: 1.00 godz./sem.
Udział w konsultacjach: 1.00 godz./sem.
Zaliczenie (sem. 2) Przygotowanie do zaliczenia: 2.00 godz./sem.
Zaliczenie ustne: 1.00 godz./sem.

Sposób wystawiania ocen składowych zajęć i oceny końcowej

Forma zajęć Sposób wystawiania oceny podsumowującej
Wykład Zaliczenie ustne.
Projekt/Seminarium Wykonanie projektu i jego prezentacja zgodnie z tematyką przedmiotu.
Ocena końcowa Średnia ważona ocen z zaliczenia i projektu (zaliczenie 50%, projekt 50 %).

Przykładowe zadania

Wymagane podczas egzaminu/zaliczenia
(-)

Realizowane podczas zajęć ćwiczeniowych/laboratoryjnych/projektowych
(-)

Inne
(-)

Czy podczas egzaminu/zaliczenia student ma możliwość korzystania z materiałów pomocniczych : nie

Treści zajęć powiazane są z prowadzonymi badaniami naukowymi: nie