Cel kształcenia i wykaz literatury

Główny cel kształcenia: Poznanie zasad funkcjonowania systemu przekazywania informacji genetycznej z pokolenia na pokolenie, zasad kontroli procesów biochemicznych i fizjologicznych w komórkach przez geny. Poznanie podstawowych metod stosowanych w badaniach i analizach molekularnych.

Ogólne informacje o zajęciach: Przedmiot realizowany w wymiarze 15 godz. wykładów i 15 godz. ćwiczeń laboratoryjnych (15 godz. wykładów i 15 godz. ćwiczeń w semestrze szóstym)

Wykaz literatury, wymaganej do zaliczenia zajęć

Literatura wykorzystywana podczas zajęć wykładowych

1	James D. Watson, Tania A. Baker, Stephen P. Bell	Molecular Biology of the Gene	Pearson.	2013
2	Marcelo L. Larramendy and Sonia Soloneski	Nucleic Acids: From Basic Aspects to Laboratory Tools	ITexli.	2016

Literatura wykorzystywana podczas zajęć ćwiczeniowych/laboratoryjnych/innych

1	Muller	Nucleic Acids from A to Z	2008.	Wiley
2	Westermeier	Electrophoresis in Practice: A Guide to Methods and Applications of DNA and Protein Separations	Viley.	2016

Literatura do samodzielnego studiowania

1

Alexander McLenann, Andy Bates, Mike White, Phil Turner

Krótkie wykłady Biologia molekularna

PWN.

2011

Wymagania wstępne w kategorii wiedzy/umiejętności/kompetencji społecznych

Wymagania formalne: brak

Wymagania wstępne w kategorii Wiedzy: znajomość biologii komórki, genetyki i biochemii

Wymagania wstępne w kategorii Umiejętności: podstawowe umiejętności pracy w laboratorium

Wymagania wstępne w kategorii Kompetencji społecznych: Umiejętność pracy w małych (3-5 osobowych), zespołach.

Efekty kształcenia dla zajęć

MEK	Student, który zaliczył zajęcia	Formy zajęć/metody dydaktyczne prowadzące do osiągnięcia danego efektu kształcenia	Metody weryfikacji każdego z wymienionych efektów kształcenia	Związki z KEK	Związki z PRK
01	Zna budowę cząsteczek kwasów nukleinowych, kod genetyczny, podstawowe procesy przekazywania informacji genetycznej i genetycznej kontroli procesów komórkowych: replikacja, transkrypcja, translacja.	wykład, laboratorium	Egzamin cz. pisemna, obserwacja wykonawstwa, raport pisemny, zaliczenie cz. praktyczna.	K_W02+++ K_W09+++	P6S_WG
02	Zna podstawowe metody analizy kwasów nukleinowych: izolacja, elektroforeza, cięcie restrykcyjne, ligacja, PCR, odwrotna transkrypcja	wykład laboratoria	Egzamin cz. pisemna, obserwacja wykonawstwa, raport pisemny, zaliczenie cz. praktyczna.	K_W02+ K_W09++ K_U05++	P6S_UW P6S_WG
03	Zna możliwości wykorzystania wiedzy z zakresu biologii molekularnej w produkcji leków i diagnostyce medycznej .	wykład, laboratorium	Egzamin cz. pisemna, obserwacja wykonawstwa, raport pisemny, zaliczenie cz. praktyczna.	K_W02+ K_W06+ K_U05+ K_U10++ K_U14+	P6S_UO P6S_UW P6S_WG
04	Potrafi pracować w małym zespole: kierować pracą, wydawać polecenia, rozdzielać zadania, wykonywać polecenia, prowadzić dokumentację.	Wykład, laboratoria	Egzamin cz. pisemna, obserwacja wykonawstwa, raport pisemny, zaliczenie cz. praktyczna.	K_U14+ K_K02+ K_K03+	P6S_KO P6S_KR P6S_UO
05	Potrafi planować doświadczenia. Potrafi planować pracę w laboratorium. Potrafi analizować wyniki przeprowadzonych badań i wyciągać z nich wnioski.	Wykład, laboratoria	Egzamin cz. pisemna, obserwacja wykonawstwa, raport pisemny, zaliczenie cz. praktyczna.	K_U05+ K_U10+	P6S_UW

Uwaga: W zależności od sytuacji epidemicznej, jeżeli nie będzie możliwości weryfikacji osiągniętych efektów uczenia się określonych w programie studiów w sposób stacjonarny w szczególności zaliczenia i egzaminy kończące określone zajęcia będą mogły się odbywać przy użyciu środków komunikacji elektronicznej (w sposób zdalny).

Treści kształcenia dla zajęć

Sem.	TK	Treści kształcenia	Realizowane na	MEK
5	TK01	Wprowadzenie do przedmiotu biologia molekularna: terminologia, struktura cząsteczek kwasów nukleinowych, kod genetyczny, ekspresja genów	W01	MEK01 MEK02 MEK03
5	TK02	Struktura informacji genetycznej u prokariotów. Budowa chromosomu bakteryjnego. Replikacja chromosomu bakteryjnego. Metylacja chromosomu bakteryjnego.	W02	MEK01
5	TK03	Plazmidy: struktura, replikacja, funkcje biologiczne.	W03	MEK01
5	TK04	Transkrypcja u prokariotów.	W04-W05	MEK01
5	TK05	Budowa i funkcja rybosomów prokariotycznych. Translacja w komórkach prokariotycznych. Potranslacyjne modyfikacje białek u prokariotów.	W06	MEK01
5	TK06	Kompartmentacja komórek eukariotycznych i jej wpływ na strukturę genomów eukariotycznych.	W07	MEK01
5	TK07	Budowa chromosomu eukariotycznego: centromer, telomery, euchromatyna, heterochromatyna, nukleosomo, histony. Replikacja chromosomu eukariotycznego.	W08	MEK01
5	TK08	Struktura genów eukariotycznych: egzony i introny, promotory.	W09-W10	MEK01
5	TK09	Transkrypcja w komórkach eukariotycznych.	W11	MEK01
5	TK10	Dojrzewanie mRNA: synteza czapeczki, składanie, poliadenylacja.	W12	MEK01
5	TK11	Regulacja ekspresji genów eukariotycznych.	W13	MEK01
5	TK12	Translacja w komórkach eukariotycznych: różnice w stosunku do procesu prokariotycznego, budowa rybosomów eukariotycznych, różnice w odczytywaniu kodu mitochondrialnego.	W14-W15	MEK01 MEK02 MEK03
5	TK13	Szkolenie BHP w laboratorium biologii molekularnej. Izolacja plazmidów z bakterii E. coli.	L01-L05	MEK01 MEK02 MEK03 MEK04 MEK05
5	TK14	Cięcie DNA enzymami restrykcyjnymi. Reakcja PCR.	L06-L10	MEK01 MEK02 MEK03 MEK04 MEK05
5	TK15	Elektroforeza DNA w żelu agarozowym. Analiza wyników wykonanych procedur.	L11-L15	MEK01 MEK02 MEK03 MEK04 MEK05

Nakład pracy studenta

Forma zajęć	Praca przed zajęciami	Udział w zajęciach	Praca po zajęciach
Wykład (sem. 5)		Godziny kontaktowe: 15.00 godz./sem.	Uzupełnienie/studiowanie notatek: 5.00 godz./sem. Studiowanie zalecanej literatury: 10.00 godz./sem.
Laboratorium (sem. 5)		Godziny kontaktowe: 15.00 godz./sem.	Dokończenia/wykonanie sprawozdania: 5.00 godz./sem.
Konsultacje (sem. 5)	Przygotowanie do konsultacji: 1.00 godz./sem.	Udział w konsultacjach: 1.00 godz./sem.
Zaliczenie (sem. 5)	Przygotowanie do zaliczenia: 5.00 godz./sem.	Zaliczenie pisemne: 1.00 godz./sem.

Sposób wystawiania ocen składowych zajęć i oceny końcowej

Forma zajęć	Sposób wystawiania oceny podsumowującej
Wykład	Ocena z egzaminu pisemnego.
Laboratorium	Zaliczenie na podstawie udziału w laboratoriach i pisemnego sprawozdania.
Ocena końcowa	Ocena końcowa to ocena z egzaminu pisemnego.

Przykładowe zadania

Wymagane podczas egzaminu/zaliczenia
(-)

Realizowane podczas zajęć ćwiczeniowych/laboratoryjnych/projektowych
(-)

Inne
(-)

Czy podczas egzaminu/zaliczenia student ma możliwość korzystania z materiałów pomocniczych : nie

Treści zajęć powiazane są z prowadzonymi badaniami naukowymi: tak

1	B. Bakera; M. Rakoczy-Trojanowska; M. Szeliga; M. Święcicka; M. Tyrka	Identification of candidate genes responsible for chasmogamy in wheat	2023
2	P. Bednarek; A. Dorczyk; T. Drzazga; D. Jasińska; P. Krajewski; B. Ługowska; R. Martofel; P. Matysik; M. Niewińska; D. Ratajczak; K. Rączka; T. Sikora; D. Tyrka; M. Tyrka; E. Witkowski; U. Woźna-Pawlak	Genome-wide association mapping in elite winter wheat breeding for yield improvement	2023
3	M. Dyda; G. Gołębiowska; M. Rapacz; M. Szechyńska-Hebda; M. Tyrka; I. Wąsek; M. Wędzony	Quantitative trait loci and candidate genes associated with freezing tolerance of winter triticale (× Triticosecale Wittmack)	2022
4	M. Dyda; G. Gołębiowska; M. Rapacz; M. Tyrka; M. Wędzony	Genetic mapping of adult-plant resistance genes to powdery mildew in triticale	2022
5	M. Dyda; G. Gołębiowska; M. Rapacz; M. Tyrka; M. Wędzony	Mapping of QTL and candidate genes associated with powdery mildew resistance in triticale (× Triticosecale Wittm.)	2022
6	P. Krajewski; R. Marcinkowski; R. Martofel; P. Matysik; M. Mokrzycka; M. Rakoczy-Trojanowska; M. Rokicki; S. Stojałowski; M. Tyrka; U. Woźna-Pawlak; B. Żmijewska	Genome-Wide Association Analysis for Hybrid Breeding in Wheat	2022
7	A. Pietrusińska; M. Tyrka	Linkage of Lr55 wheat leaf rust resistance gene with microsatellite and DArT-based markers	2021
8	B. Bakera; P. Krajewski; M. Mokrzycka; M. Rakoczy-Trojanowska; M. Szeliga; M. Święcicka; M. Tyrka	Identification of Rf Genes in Hexaploid Wheat (Triticumaestivum L.) by RNA-Seq and Paralog Analyses	2021
9	B. Bakera; P. Krajewski; P. Matysik; M. Mokrzycka; M. Rakoczy-Trojanowska; M. Rokicki; S. Stojałowski; M. Szeliga; D. Tyrka; M. Tyrka	Evaluation of genetic structure in European wheat cultivars and advanced breeding lines using high-density genotyping-by-sequencing approach	2021
10	J. Buczkowicz; T. Drzazga; B. Ługowska; P. Matysik; K. Rubrycki; M. Semik; D. Tyrka; M. Tyrka; E. Witkowski	Identyfikacja efektywnych genów odporności na wybrane choroby wirusowe i grzybowe pszenicy zwyczajnej	2021
11	J. Buczkowicz; T. Drzazga; G. Fic; M. Jaromin; P. Krajewski; P. Matysik; R. Mazur; P. Milczarski; T. Sikora; M. Szeliga; D. Tyrka; M. Tyrka; E. Witkowski	Selekcja genomowa pszenicy ozimej	2021
12	E. Ciszkowicz; E. Kaznowska; P. Porzycki; M. Semik; M. Tyrka	MiR-93/miR-375: Diagnostic Potential, Aggressiveness Correlation and Common Target Genes in Prostate Cancer	2020
13	G. Czajowski; M. Karbarz; M. Pojmaj; A. Strzembicka; D. Tyrka; M. Tyrka; A. Wardyńska; M. Wędzony	Quantitative trait loci mapping of adult-plant resistance to powdery mildew in triticale	2020
14	J. Ciura; M. Szeliga; M. Tyrka	Representational Difference Analysis of Transcripts Involved in Jervine Biosynthesis	2020
15	J. Ciura; M. Grzesik; M. Szeliga; M. Tyrka	Identification of candidate genes involved in steroidal alkaloids biosynthesis in organ-specific transcriptomes of Veratrum nigrum L.	2019
16	M. Dyda; M. Szechyńska-Hebda; M. Tyrka; I. Wąsek; M. Wędzony	Local and systemic regulation of PSII efficiency in triticale infected by the hemibiotrophic pathogen Microdochium nivale	2019
17	M. Dziurka; K. Hura; T. Hura; A. Ostrowska; M. Tyrka	Participation of Wheat and Rye Genome in Drought Induced Senescence in Winter Triticale (X Triticosecale Wittm.)	2019
18	Z. Banaszak; A. Fiust; Z. Nita; W. Orłowska-Job; M. Pojmaj; M. Rapacz; M. Tyrka; M. Wójcik-Jagła	Sposób selekcji mrozoodpornych genotypów jęczmienia ozimego	2019