Cel kształcenia i wykaz literatury

Główny cel kształcenia: Zapoznanie studentów z metodą qPCR i jej możliwościami w badaniu poziomu ekspresji genów

Ogólne informacje o zajęciach: Moduł realizowany jest w formie laboratoriów 5 godzinnych

Materiały dydaktyczne: Instrukcja laboratoryjna

Wykaz literatury, wymaganej do zaliczenia zajęć

Wymagania wstępne w kategorii wiedzy/umiejętności/kompetencji społecznych

Wymagania formalne: Rejestracja na semestr, zakwalifikowanie się do projektu

Wymagania wstępne w kategorii Wiedzy: Znajomość budowy DNA i metody PCR

Wymagania wstępne w kategorii Umiejętności: Umiejętność obsługi pipet automatycznych i bazy NCBI

Wymagania wstępne w kategorii Kompetencji społecznych: Umiejętność pracy indywidualnej i zespołowej

Efekty kształcenia dla zajęć

MEK	Student, który zaliczył zajęcia	Formy zajęć/metody dydaktyczne prowadzące do osiągnięcia danego efektu kształcenia	Metody weryfikacji każdego z wymienionych efektów kształcenia	Związki z KEK	Związki z OEK
01	potrafi zaplanować doświadczenie, którego celem jest zbadanie zmian poziomu ekspresji genu	ćwiczenia problemowe	raport pisemny	K_W02+++ K_U02+++	T2A_W02+++ T2A_U01+++ T2A_U02+ T2A_U03+ T2A_U04+++
02	potrafi wykonać doświadczenie, którego celem jest zbadanie zmian ekspresji genów i przeanalizować uzyskane wyniki	laboratorium	raport pisemny	K_W01+ K_W02++ K_U02+++ K_K01+++	T2A_W02++ T2A_U01+ T2A_U02++ T2A_U03+ T2A_U04++ T2A_K01+++ T2A_K02+

Uwaga: W zależności od sytuacji epidemicznej, jeżeli nie będzie możliwości weryfikacji osiągniętych efektów uczenia się określonych w programie studiów w sposób stacjonarny w szczególności zaliczenia i egzaminy kończące określone zajęcia będą mogły się odbywać przy użyciu środków komunikacji elektronicznej (w sposób zdalny).

Treści kształcenia dla zajęć

Sem.	TK	Treści kształcenia	Realizowane na	MEK
6	TK01	Zna zasadę działania metody qPCR oraz możliwości jej zastosowania do rozwiązywania różnych problemów z zakresu biologii i biochemii	-	MEK01
6	TK02	Posiada umiejętności do wykonania oznaczenia qPCR i analizy danych metodą ΔΔCt	-	MEK02

Nakład pracy studenta

Forma zajęć	Praca przed zajęciami	Udział w zajęciach	Praca po zajęciach
Laboratorium (sem. 6)		Godziny kontaktowe: 15.00 godz./sem.	Dokończenia/wykonanie sprawozdania: 1.00 godz./sem.
Konsultacje (sem. 6)
Zaliczenie (sem. 6)

Sposób wystawiania ocen składowych zajęć i oceny końcowej

Forma zajęć	Sposób wystawiania oceny podsumowującej
Laboratorium
Ocena końcowa

Przykładowe zadania

Wymagane podczas egzaminu/zaliczenia
(-)

Realizowane podczas zajęć ćwiczeniowych/laboratoryjnych/projektowych
(-)

Inne
(-)

Czy podczas egzaminu/zaliczenia student ma możliwość korzystania z materiałów pomocniczych : nie

Treści zajęć powiazane są z prowadzonymi badaniami naukowymi: tak

1	B. Bakera; M. Rakoczy-Trojanowska; M. Szeliga; M. Święcicka; M. Tyrka	Identification of candidate genes responsible for chasmogamy in wheat	2023
2	P. Bednarek; A. Dorczyk; T. Drzazga; D. Jasińska; P. Krajewski; B. Ługowska; R. Martofel; P. Matysik; M. Niewińska; D. Ratajczak; K. Rączka; T. Sikora; D. Tyrka; M. Tyrka; E. Witkowski; U. Woźna-Pawlak	Genome-wide association mapping in elite winter wheat breeding for yield improvement	2023
3	M. Dyda; G. Gołębiowska; M. Rapacz; M. Szechyńska-Hebda; M. Tyrka; I. Wąsek; M. Wędzony	Quantitative trait loci and candidate genes associated with freezing tolerance of winter triticale (× Triticosecale Wittmack)	2022
4	M. Dyda; G. Gołębiowska; M. Rapacz; M. Tyrka; M. Wędzony	Genetic mapping of adult-plant resistance genes to powdery mildew in triticale	2022
5	M. Dyda; G. Gołębiowska; M. Rapacz; M. Tyrka; M. Wędzony	Mapping of QTL and candidate genes associated with powdery mildew resistance in triticale (× Triticosecale Wittm.)	2022
6	P. Krajewski; R. Marcinkowski; R. Martofel; P. Matysik; M. Mokrzycka; M. Rakoczy-Trojanowska; M. Rokicki; S. Stojałowski; M. Tyrka; U. Woźna-Pawlak; B. Żmijewska	Genome-Wide Association Analysis for Hybrid Breeding in Wheat	2022
7	A. Pietrusińska; M. Tyrka	Linkage of Lr55 wheat leaf rust resistance gene with microsatellite and DArT-based markers	2021
8	B. Bakera; P. Krajewski; M. Mokrzycka; M. Rakoczy-Trojanowska; M. Szeliga; M. Święcicka; M. Tyrka	Identification of Rf Genes in Hexaploid Wheat (Triticumaestivum L.) by RNA-Seq and Paralog Analyses	2021
9	B. Bakera; P. Krajewski; P. Matysik; M. Mokrzycka; M. Rakoczy-Trojanowska; M. Rokicki; S. Stojałowski; M. Szeliga; D. Tyrka; M. Tyrka	Evaluation of genetic structure in European wheat cultivars and advanced breeding lines using high-density genotyping-by-sequencing approach	2021
10	J. Buczkowicz; T. Drzazga; B. Ługowska; P. Matysik; K. Rubrycki; M. Semik; D. Tyrka; M. Tyrka; E. Witkowski	Identyfikacja efektywnych genów odporności na wybrane choroby wirusowe i grzybowe pszenicy zwyczajnej	2021
11	J. Buczkowicz; T. Drzazga; G. Fic; M. Jaromin; P. Krajewski; P. Matysik; R. Mazur; P. Milczarski; T. Sikora; M. Szeliga; D. Tyrka; M. Tyrka; E. Witkowski	Selekcja genomowa pszenicy ozimej	2021
12	E. Ciszkowicz; E. Kaznowska; P. Porzycki; M. Semik; M. Tyrka	MiR-93/miR-375: Diagnostic Potential, Aggressiveness Correlation and Common Target Genes in Prostate Cancer	2020
13	G. Czajowski; M. Karbarz; M. Pojmaj; A. Strzembicka; D. Tyrka; M. Tyrka; A. Wardyńska; M. Wędzony	Quantitative trait loci mapping of adult-plant resistance to powdery mildew in triticale	2020
14	J. Ciura; M. Szeliga; M. Tyrka	Representational Difference Analysis of Transcripts Involved in Jervine Biosynthesis	2020
15	J. Ciura; M. Grzesik; M. Szeliga; M. Tyrka	Identification of candidate genes involved in steroidal alkaloids biosynthesis in organ-specific transcriptomes of Veratrum nigrum L.	2019
16	M. Dyda; M. Szechyńska-Hebda; M. Tyrka; I. Wąsek; M. Wędzony	Local and systemic regulation of PSII efficiency in triticale infected by the hemibiotrophic pathogen Microdochium nivale	2019
17	M. Dziurka; K. Hura; T. Hura; A. Ostrowska; M. Tyrka	Participation of Wheat and Rye Genome in Drought Induced Senescence in Winter Triticale (X Triticosecale Wittm.)	2019
18	Z. Banaszak; A. Fiust; Z. Nita; W. Orłowska-Job; M. Pojmaj; M. Rapacz; M. Tyrka; M. Wójcik-Jagła	Sposób selekcji mrozoodpornych genotypów jęczmienia ozimego	2019