Cel kształcenia i wykaz literatury

Główny cel kształcenia: wiedza na temat chemii układów biologicznych, biomolekuły, ich budowa oraz funkcja, podstawowe procesy biochemiczne, procesy energetyczne

Ogólne informacje o zajęciach: Moduł realizowany jest w semestrze 7. Obejmuje 30 godzin wykładowych oraz 15 godzin laboratoryjnych kończąc się egzaminem.

Materiały dydaktyczne: -

Inne: -

Wykaz literatury, wymaganej do zaliczenia zajęć

Literatura do samodzielnego studiowania

1	Lubert Stryer	Biochemia	PWN.	-
2	Tymoczko, Berg, Stryer	Biochemia - krótki kurs	PWN.	-

Wymagania wstępne w kategorii wiedzy/umiejętności/kompetencji społecznych

Wymagania formalne: rejestracja na semestr

Wymagania wstępne w kategorii Wiedzy: Wiedza na temat: podstawy chemii organicznej, chemia nieorganiczna,

Wymagania wstępne w kategorii Umiejętności: stosowanie znanych reakcji chemicznych oraz mechanizmów r. chem. do analizy procesów biologicznych

Wymagania wstępne w kategorii Kompetencji społecznych: efektywna współpraca z osobami z grupy

Efekty kształcenia dla zajęć

MEK	Student, który zaliczył zajęcia	Formy zajęć/metody dydaktyczne prowadzące do osiągnięcia danego efektu kształcenia	Metody weryfikacji każdego z wymienionych efektów kształcenia	Związki z KEK	Związki z PRK
01	Ma wiedzę w tematyce pracy z materiałem biologicznym.	wykład, laboratorium	zaliczenie cz. pisemna, kolokwium	K_W03++ K_W06++	P6S_WG
02	Potrafi wykonywać analizy substancji pochodzenia biologicznego	wykład, laboratorium	zaliczenie cz. pisemna, kolokwium	K_U03++ K_U04++ K_U11++ K_K01++ K_K02++	P6S_KK P6S_KO P6S_KR P6S_UK P6S_UO P6S_UW
03	posiada wiedzę na temat budowy bialek, kwasow nukleinowych; wlasciwosci kwasowo-zasadowych aminokwasow, peptydow i bialek; podstawowe informacje o metabolizmie; transkrypcja; translacja.	wykład	kolokwium, zaliczenie cz. pisemna	K_W03+ K_U04+	P6S_UW P6S_WG

Uwaga: W zależności od sytuacji epidemicznej, jeżeli nie będzie możliwości weryfikacji osiągniętych efektów uczenia się określonych w programie studiów w sposób stacjonarny w szczególności zaliczenia i egzaminy kończące określone zajęcia będą mogły się odbywać przy użyciu środków komunikacji elektronicznej (w sposób zdalny).

Treści kształcenia dla zajęć

Sem.	TK	Treści kształcenia	Realizowane na	MEK
7	TK01	Praca z materialem biologicznym, analiza jakosciowa cukrow, aminokwasow	L01-03	MEK01 MEK02
7	TK02	Struktura, podział i właściwości aminokwasów. Wiązanie peptydowe. Struktura białek. Techniki oczyszczania i badania białek. Budowa enzymów i mechanizm katalizy enzymatycznej. Kinetyka reakcji enzymatycznych. Nukleotydy. Budowa i funkcja kwasów nukleinowych. Mechanizm replikacji DNA u prokariotów i eukariotów. Rodzaje RNA w komórce. Synteza (translacja) białka u prokariotów i eukariotów. Węglowodany. Struktura mono-, di- i polisacharydów. Właściwości cukrów, ich rola i wystepowanie w przyrodzie. Glikoproteiny. Weglowodany jako substarty energetyczne: glikoliza i glukoneogeneza. Lipidy: struktura i funkcje kwasów tłuszczowych. Triacyloglicerole. Metabolizm lipidów; synteza i rozpad kwasów tłuszczowych w komórce.	W01-07	MEK01 MEK03

Nakład pracy studenta

Forma zajęć	Praca przed zajęciami	Udział w zajęciach	Praca po zajęciach
Wykład (sem. 7)		Godziny kontaktowe: 18.00 godz./sem.	Uzupełnienie/studiowanie notatek: 10.00 godz./sem. Studiowanie zalecanej literatury: 15.00 godz./sem.
Laboratorium (sem. 7)	Przygotowanie do laboratorium: 3.00 godz./sem. Przygotowanie do kolokwium: 15.00 godz./sem.	Godziny kontaktowe: 9.00 godz./sem.	Dokończenia/wykonanie sprawozdania: 15.00 godz./sem.
Konsultacje (sem. 7)		Udział w konsultacjach: 2.00 godz./sem.
Zaliczenie (sem. 7)	Przygotowanie do zaliczenia: 25.00 godz./sem.	Zaliczenie pisemne: 2.00 godz./sem.

Sposób wystawiania ocen składowych zajęć i oceny końcowej

Forma zajęć	Sposób wystawiania oceny podsumowującej
Wykład	kolokwium
Laboratorium	kolokwia cząstkowe
Ocena końcowa	ocena koncowa K = w(0,5 x W+ 0,5 x L) W - ocena z zaliczenia pisemnego z materiału wykładowego L - średnia z ocen z kolokwiów cząstkowych w - wsp. terminu - 1 dla 1-terminu, 0,9 dla 2-terminu, 0,8 dla 3-terminu Ocena pozytywna - min 50% ilości maksymalnej punktów; kolejne 10% - wzrost oceny o 0,5 stopnia do 5.0

Przykładowe zadania

Wymagane podczas egzaminu/zaliczenia
(-)

Realizowane podczas zajęć ćwiczeniowych/laboratoryjnych/projektowych
(-)

Inne
(-)

Czy podczas egzaminu/zaliczenia student ma możliwość korzystania z materiałów pomocniczych : nie

Treści zajęć powiazane są z prowadzonymi badaniami naukowymi: tak

1	A. Kołodziej; Z. Krupa; J. Nizioł; A. Ossolińska; K. Ossoliński; T. Ossoliński; A. Płaza-Altamer; T. Ruman	Untargeted metabolomics of bladder tissue using liquid chromatography and quadrupole time-of-flight mass spectrometry for cancer biomarker detection	2024
2	A. Łyskowski; M. Misiorek; Z. Rauk; Z. Setkowicz; Ż. Szymaszek; M. Twardowska; Ł. Uram; S. Wołowiec	The Importance of Biotinylation for the Suitability of Cationic and Neutral Fourth-Generation Polyamidoamine Dendrimers as Targeted Drug Carriers in the Therapy of Glioma and Liver Cancer	2024
3	B. Guratowska; A. Kuźniar; J. Nizioł; A. Nowak; M. Okrasa; T. Ruman; M. Ryngajłło; J. Szulc	Uncontrolled Post-Industrial Landfill—Source of Metals, Potential Toxic Compounds, Dust, and Pathogens in Environment—A Case Study	2024
4	M. Misiorek; N. Pieńkowska; M. Siorek; Ż. Szymaszek; M. Twardowska; Ł. Uram; S. Wołowiec	Repurposed Drugs Celecoxib and Fmoc-L-Leucine Alone and in Combination as Temozolomide-Resistant Antiglioma Agents—Comparative Studies on Normal and Immortalized Cell Lines, and on C. elegans	2024
5	V. Copie; A. Kołodziej; Z. Krupa; J. Nizioł; A. Ossolińska; K. Ossoliński; T. Ossoliński; A. Płaza-Altamer; T. Ruman; B. Tripet	Metabolomic profiling of human bladder tissue extracts	2024
6	Z. Krupa; J. Nizioł; T. Ruman	Direct Three-Dimensional Mass Spectrometry Imaging with Laser Ablation Remote Atmospheric Pressure Photoionization/Chemical Ionization	2024
7	Z. Krupa; M. Misiorek; J. Nizioł; T. Ruman	Infrared Laser-Based Selected Reaction Monitoring Mass Spectrometry Imaging of Banana (Musa spp.) Tissue—New Method for Detection and Spatial Localization of Metabolites in Food	2024
8	A. Arendowski; A. Kołodziej; J. Nizioł; A. Ossolińska; K. Ossoliński; T. Ossoliński; A. Płaza-Altamer; T. Ruman	Monoisotopic silver nanoparticles-based mass spectrometry imaging of human bladder cancer tissue: Biomarker discovery	2023
9	A. Kołodziej; A. Nieczaj; J. Nizioł; A. Ossolińska; K. Ossoliński; T. Ossoliński; A. Płaza-Altamer; T. Ruman	Untargeted urinary metabolomics for bladder cancer biomarker screening with ultrahigh-resolution mass spectrometry	2023
10	A. Kołodziej; Z. Krupa; J. Nizioł; A. Płaza-Altamer; T. Ruman	Infrared pulsed fiber laser-produced gold and silver-109 nanoparticles for laser desorption/ionization mass spectrometry of steroid hormones	2023
11	M. Dudek; B. Gutarowska; M. Komar; J. Nizioł; P. Nowicka-Krawczyk; T. Ruman	Biodeterioration potential of algae on building materials - Model study	2023
12	S. Kuberski; A. Kuźniar; J. Nizioł; A. Nowak; I. Nowak; M. Okrasa; T. Ruman; B. Szponar; J. Szulc	Biological and chemical contamination of illegal, uncontrolled refuse storage areas in Poland	2023
13	V. Copie; A. Kołodziej; A. Nieczaj; J. Nizioł; A. Ossolińska; K. Ossoliński; T. Ossoliński; A. Płaza-Altamer; T. Ruman; B. Tripet	Targeted and untargeted urinary metabolic profiling of bladder cancer	2023
14	A. Kołodziej; J. Nizioł; A. Ossolińska; K. Ossoliński; T. Ossoliński; A. Płaza-Altamer; T. Ruman	Untargeted ultra-high-resolution mass spectrometry metabolomic profiling of blood serum in bladder cancer	2022
15	A. Kołodziej; J. Nizioł; A. Płaza-Altamer; T. Ruman	Infrared pulsed fiber laser-produced silver-109 nanoparticles for laser desorption/ionization mass spectrometry of 3-hydroxycarboxylic acids	2022
16	A. Kołodziej; J. Nizioł; A. Płaza-Altamer; T. Ruman	Infrared pulsed fiber laser-produced silver-109-nanoparticles for laser desorption/ionization mass spectrometry of amino acids	2022
17	A. Kołodziej; J. Nizioł; A. Płaza-Altamer; T. Ruman	Infrared pulsed fiber laser-produced silver-109-nanoparticles for laser desorption/ionization mass spectrometry of carboxylic acids	2022
18	A. Kołodziej; J. Nizioł; A. Płaza-Altamer; T. Ruman	Laser Ablation Synthesis in Solution and Nebulization of Silver-109 Nanoparticles for Mass Spectrometry and Mass Spectrometry Imaging	2022
19	A. Kołodziej; J. Nizioł; A. Płaza-Altamer; T. Ruman	Laser generated gold nanoparticles for mass spectrometry of low molecular weight compounds	2022
20	A. Kołodziej; J. Nizioł; A. Płaza-Altamer; T. Ruman	Obrazowanie tkanek za pomocą spektrometrii mas z laserową desorpcją/jonizacją	2022
21	B. Gutarowska; M. Komar; P. Konca; J. Nizioł; P. Nowicka-Krawczyk; T. Ruman	Metabolomic analysis of photosynthetic biofilms on building façades in temperate climate zones	2022
22	B. Gutarowska; T. Ruman; J. Szulc	Metagenomika i metabolomika – nowoczesne metody systemowe w identyfikacji mikroorganizmów oraz metabolitów odpowiedzialnych za niszczenie obiektów zabytkowych	2022
23	S. Kuberski; J. Nizioł; A. Nowak; M. Okrasa; T. Ruman; J. Szulc	Assessment of Physicochemical, Microbiological and Toxicological Hazards at an Illegal Landfill in Central Poland	2022
24	V. Copie; A. Kołodziej; J. Nizioł; K. Nogueira; L. Nogueira; A. Ossolińska; K. Ossoliński; T. Ossoliński; A. Płaza-Altamer; T. Ruman; B. Tripet	Metabolomic and elemental profiling of blood serum in bladder cancer	2022
25	A. Arendowski; J. Nizioł; A. Ossolińska; K. Ossoliński; T. Ossoliński; T. Ruman	Serum and urine analysis with gold nanoparticle-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry for renal cell carcinoma metabolic biomarkers discovery	2021
26	A. Arendowski; V. Copie; J. Nizioł; K. Nogueira; L. Nogueira; K. Ossoliński; T. Ruman; B. Tripet	Metabolomic and elemental profiling of human tissue in kidney cancer	2021
27	A. Arendowski; V. Copie; J. Nizioł; K. Ossoliński; T. Ruman; B. Tripet	Nuclear magnetic resonance and surface-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry-based metabolome profiling of urine samples from kidney cancer patients	2021
28	A. Kołodziej; T. Ruman; J. Szulc	Silver-109/Silver/Gold Nanoparticle-Enhanced Target Surface-Assisted Laser Desorption/Ionisation Mass Spectrometry—The New Methods for an Assessment of Mycotoxin Concentration on Building Materials	2021
29	B. Gutarowska; K. Majchrzycka; J. Nizioł; A. Nowak; M. Okrasa; T. Ruman; M. Sulyok; B. Szponar; J. Szulc	Microbiological and Toxicological Hazards in Sewage Treatment Plant Bioaerosol and Dust	2021
30	I. Beech; A. Drążkowska; B. Guratowska; J. Karbowska-Berent; T. Ruman; J. Sunner; J. Szulc	Metabolomics and metagenomics analysis of 18th century archaeological silk	2021
31	M. Misiorek; J. Nizioł; T. Ruman	Zastosowanie spektometrii mas do obrazowania rozmieszczenia flawonoidów w owocu truskawki	2021
32	A. Arendowski; J. Nizioł; K. Ossoliński; T. Ruman	Gold nanostructures - assisted laser desorption/ionization mass spectrometry for kidney cancer blood serum biomarker screening	2020
33	A. Arendowski; J. Nizioł; K. Ossoliński; T. Ruman	Screening of Urinary Renal Cancer Metabolic Biomarkers with Gold Nanoparticles-assisted Laser Desorption/Ionization Mass Spectrometry	2020
34	A. Arendowski; V. Copie; J. Nizioł; K. Ossoliński; T. Ruman; B. Tripet	Nuclear magnetic resonance and surface-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry-based serum metabolomics of kidney cancer	2020
35	A. Filipowicz-Rachwał; J. Markowicz; M. Misiorek; Ł. Uram; E. Wałajtys-Rode; S. Wołowiec	Celecoxib substituted biotinylated poly(amidoamine) G3 dendrimer as potential treatment for temozolomide resistant glioma therapy and anti-nematode agent	2020
36	A. Kołodziej; J. Nizioł; T. Ruman	Gold and silver nanoparticles-based laser desorption/ionization mass spectrometry method for detection and quantification of carboxylic acids	2020
37	B. Guratowska; J. Karbowska-Berent; T. Kozielec; T. Ruman; J. Szulc	Analyses of microorganisms and metabolites diversity on historic photographs using innovative methods	2020
38	B. Gutarowska; A. Jachowicz; S. Kowalska; W. Machnowski; T. Ruman; A. Steglinska; J. Szulc	Beeswax-Modified Textiles: Method of Preparation and Assessment of Antimicrobial Properties	2020
39	B. Gutarowska; I. Jablonskaja; E. Jabłońska; J. Karbowska-Berent; T. Ruman; J. Szulc	Metabolomics and metagenomics characteristic of historic beeswax seals	2020
40	E. Chmiel; A. Czerniecka-Kubicka; M. Misiorek; M. Pyda; P. Tutka; Ł. Uram; M. Walczak; S. Wołowiec	Stepwise glucoheptoamidation of poly(amidoamine) dendrimer G3 to tune physicochemical properties of the potential drug carrier: in vitro tests for cytisine conjugates	2020
41	I. Beech; J. Nizioł; A. Ossolińska; K. Ossoliński; T. Ossoliński; A. Płaza; T. Ruman; J. Sunner	Localization of Metabolites of Human Kidney Tissue with Infrared Laser-Based Selected Reaction Monitoring Mass Spectrometry Imaging and Silver-109 Nanoparticle-Based Surface Assisted Laser Desorption/Ionization Mass Spectrometry Imaging	2020
42	T. Ruman; J. Szulc	Laser Ablation Remote-Electrospray Ionisation Mass Spectrometry (LARESI MSI) Imaging—New Method for Detection and Spatial Localization of Metabolites and Mycotoxins Produced by Moulds	2020
43	A. Arendowski; J. Kucharz; J. Nizioł; A. Ossolińska; K. Ossoliński; T. Ossoliński; T. Ruman; P. Wiechno	Mass spectrometry-based metabolomic profiling of prostate cancer-a pilot study	2019
44	A. Filipowicz-Rachwał; J. Markowicz; M. Misiorek; M. Pichla; Ł. Uram; E. Wałajtys-Rode; S. Wołowiec	The Effect of Biotinylated PAMAM G3 Dendrimers Conjugated with COX-2 Inhibitor (celecoxib) and PPARγ Agonist (Fmoc-L-Leucine) on Human Normal Fibroblasts, Immortalized Keratinocytes and Glioma Cells in Vitro	2019
45	A. Filipowicz-Rachwał; M. Misiorek; Ł. Uram; E. Wałajtys-Rode; A. Winiarz; S. Wołowiec	Synthesis and Different Effects of Biotinylated PAMAM G3 Dendrimer Substituted with Nimesulide in Human Normal Fibroblasts and Squamous Carcinoma Cells	2019
46	J. Cebulski; M. Kus-Liśkiewicz; T. Ruman; M. Stompor; D. Szmuc; K. Szmuc; Ł. Szyller; S. Wołowiec; I. Zawlik	Silver nanoparticles deposited on calcium hydrogenphosphate - silver phosphate matrix; biological activity of the composite	2019
47	M. Misiorek; J. Nizioł; T. Ruman	Mass spectrometry imaging of low molecular weight metabolites in strawberry fruit (Fragaria x ananassa Duch.) cv. Primoris with 109Ag nanoparticle enhanced target	2019