Cel kształcenia i wykaz literatury

Główny cel kształcenia: Zapoznanie z podstawowymi zasadami działania leków na poziomie molekularnym, klasycznymi metodami farmakologii molekularnej oraz nowymi trendami w farmakologii, farmakogenetyce i farmakogenomice.

Ogólne informacje o zajęciach: Moduł realizowany na drugim semestrze studiów drugiego stopnia jako obowiązkowy dla specjalności Oczyszczanie i analiza produktów biotechnologicznych. Realizowany jako 30 godzin wykładów i 15 godzin ćwiczeń laboratoryjnych, zakończony zaliczeniem.

Materiały dydaktyczne: Strona internetowa dla studentów: http://www.nrl.uvlf.sk/prz/

Wykaz literatury, wymaganej do zaliczenia zajęć

Literatura wykorzystywana podczas zajęć wykładowych

1	Rosypal S.	Úvod do molekulární biologie (rozdziały 1-4)	Brno.	2002
2	Křemen J. et al.	Techniky molekulární biologie a jejich využití v medicíně. Skriptum UK 1.LF	Karolinum, Praha.	1998
3	Kalow, Meyer, Tyndale	Pharmacogenomics	Marcel Dekker.	2001

Literatura wykorzystywana podczas zajęć ćwiczeniowych/laboratoryjnych/innych

1

J. Legáth

Ćwiczenia - Molekularne podstawy farmakologii

http://www.nrl.uvlf.sk/prz/cwmf.html.

2013

Wymagania wstępne w kategorii wiedzy/umiejętności/kompetencji społecznych

Wymagania formalne: Wymagane zaliczenie przedmiotów: Techniki immunologiczne w biotechnologii, Biochemia, Enzymologia

Wymagania wstępne w kategorii Wiedzy: Podstawowa wiedza z zakresu biochemii, immunologii i enzymologii.

Wymagania wstępne w kategorii Umiejętności: Umiejętność wyszukiwania informacji i samokształcenia.

Wymagania wstępne w kategorii Kompetencji społecznych: Umiejętność pracy indywidualnej i zespołowej.

Efekty kształcenia dla zajęć

MEK	Student, który zaliczył zajęcia	Formy zajęć/metody dydaktyczne prowadzące do osiągnięcia danego efektu kształcenia	Metody weryfikacji każdego z wymienionych efektów kształcenia	Związki z KEK	Związki z PRK
01	Zna podstawowe terminy i poprawnie stosuje nomenklaturę farmakologiczna.	wykład	zaliczenie cz. pisemna	K_W03++	P7S_WG
02	Ma podstawową wiedzę na temat procesu opracowywania leków oraz zastosowania leków naturalnych i biofarmaceutyków	wykład	zaliczenie cz. pisemna	K_W03++ K_U15++	P7S_UW P7S_WG
03	Ma podstawową wiedzę z zakresu przyczyn powstawania chorób.	wykład	zaliczenie cz. pisemna	K_W03+++	P7S_WG
04	Zna podstawowe cele molekularne działania leków.	wykład	zaliczenie cz. pisemna	K_W03+++	P7S_WG
05	Zna podstawowe metody badawcze stosowane w farmakologii molekularnej.	wykład, laboratorium	zaliczenie cz. pisemna	K_W03+++ K_U15++	P7S_UW P7S_WG
06	Zna nowe trendy oraz problemy etyczne współczesnej farmakologii.	wykład, laboratorium	zaliczenie cz. pisemna	K_W03+++ K_K03+++	P7S_KR P7S_WG

Uwaga: W zależności od sytuacji epidemicznej, jeżeli nie będzie możliwości weryfikacji osiągniętych efektów uczenia się określonych w programie studiów w sposób stacjonarny w szczególności zaliczenia i egzaminy kończące określone zajęcia będą mogły się odbywać przy użyciu środków komunikacji elektronicznej (w sposób zdalny).

Treści kształcenia dla zajęć

Sem.	TK	Treści kształcenia	Realizowane na	MEK
2	TK01	Wprowadzenie do farmakologii molekularnej, definicja, terminologia, metodologia i wprowadzenie do uzyskiwania leków	W01	MEK01 MEK02
2	TK02	Cykl życiowy komórek prokariotycznych i eukariotycznych, mechanizmy regulatorowe, apoptoza i nekroza	W02	MEK03
2	TK03	Patogeny komórkowe: wirusy, bakteriofagi ich funkcje w nauce i biotechnologii. Choroby prionowe.	W03	MEK03
2	TK04	Mechanizmy działania antywirotyków, klasyfikacja antywirotyków, dezynfektanty i odporność	W04	MEK03 MEK04
2	TK05	Leki i błona komórkowa, mechanizmy transportowania, mechanizmy przekazywania sygnałów, kanały jonowe, chemoreceptory, klasyfikacja receptorów, teoria receptorowa	W05	MEK04
2	TK06	Podstawy enzymologii. Enzymy jądrowe i mitochondrialne, enzymy pozakomórkowe i metabolizm leków, farmakogenetyka i farmakogenomika	W06	MEK01 MEK04
2	TK07	Organizacja komórek, tkanek i organów, układy organów, mechanizmy różnicowania komórek. Przekazywanie sygnałów pomiędzy komórkami, potencjał działania, przekaźniki, synapsy. Wpływ tworzenia i przekazywania wzbudzenia lekiem – mechanizm działania.	W07	MEK03 MEK04
2	TK08	Mutagenność, kancerogenność, nowotwór, mechanizm działania cytostatyków, odporność	W08	MEK03 MEK04
2	TK09	Struktura białek i wykorzystanie zmiany struktury białek do tworzenia nowych leków. Znaczenie białka p53.	W09	MEK02 MEK03 MEK04
2	TK10	Molekularna podstawa wyboru stanu patofizjologicznego (choroby neurodegradacyjne, układu krążenia itp.) – molekularny wpływ leków na te stany	W10	MEK03 MEK04
2	TK11	Podstawy molekularne immunofarmakologii i immunotoksykologii, zapalenie, alergia. Leki wpływające na system immunologiczny	W11	MEK01 MEK03 MEK04
2	TK12	Leki naturalne pochodzenia roślinnego i zwierzęcego – przygotowanie i rozdział, mechanizm oddziaływań molekularnych w organizmach.	W12	MEK02
2	TK13	Zastosowanie i wykorzystanie metod molekularnych w farmakologii – biofarmaceutyki	W13	MEK02 MEK06
2	TK14	GMO i ich produkty i problemy etyczne biologii molekularnej i farmakologii	W14	MEK01 MEK06
2	TK15	Kultury komórkowe – prowadzenie, namnażanie i przygotowanie do testowania nowych leków przeciwnowotworowych	L01	MEK05 MEK06
2	TK16	Metody histochemiczne – przygotowanie, metody barwienia, określanie enzymów międzykomórkowych w komórkach	L02	MEK05
2	TK17	Modelowanie efektów i oddziaływań leków naturalnych i syntetycznych na błony	L03	MEK04 MEK05
2	TK18	Metodologia i metody w farmakogenetyce i farmakogenomice – modelowanie enzymobiotyków i innych białek aktywnych biologicznie (ćwiczenia modelowe)	L04	MEK05 MEK06

Nakład pracy studenta

Forma zajęć	Praca przed zajęciami	Udział w zajęciach	Praca po zajęciach
Wykład (sem. 2)		Godziny kontaktowe: 30.00 godz./sem.	Uzupełnienie/studiowanie notatek: 5.00 godz./sem.
Laboratorium (sem. 2)	Przygotowanie do laboratorium: 4.00 godz./sem. Przygotowanie do kolokwium: 8.00 godz./sem.	Godziny kontaktowe: 15.00 godz./sem.
Konsultacje (sem. 2)		Udział w konsultacjach: 2.00 godz./sem.
Zaliczenie (sem. 2)	Przygotowanie do zaliczenia: 12.00 godz./sem.	Zaliczenie pisemne: 1.00 godz./sem.

Sposób wystawiania ocen składowych zajęć i oceny końcowej

Forma zajęć	Sposób wystawiania oceny podsumowującej
Wykład	zaliczenie na podstawie kolokwium zaliczeniowego obejmującego część wykładową i laboratoryjną
Laboratorium	zaliczenie na podstawie kolokwium zaliczeniowego obejmującego część wykładową i laboratoryjną
Ocena końcowa	Ocena końcowa przedmiotu wystawiana na podstawie zaliczenia pisemnego obejmującego zagadnienia z wykładu oraz ćwiczeń. Do zdobycia 100 punktów;51-60p. - 3.0; 61-70p. - 3.5; 71-80p. - 4.0; 81-90p. - 4.5; 91-100p. - 5.0

Przykładowe zadania

Wymagane podczas egzaminu/zaliczenia
(-)

Realizowane podczas zajęć ćwiczeniowych/laboratoryjnych/projektowych
(-)

Inne
(-)

Czy podczas egzaminu/zaliczenia student ma możliwość korzystania z materiałów pomocniczych : nie

Treści zajęć powiazane są z prowadzonymi badaniami naukowymi: tak

1	A. Bocian; J. Buczkowicz; K. Hus; J. Legath; T. Litschka-Koen; V. Petrilla; M. Petrillova; M. Pietrowska	Venom diversity in Naja mossambica: Insights from proteomic and immunochemical analyses reveal intraspecific differences	2024
2	B. Bakera; M. Rakoczy-Trojanowska; M. Szeliga; M. Święcicka; M. Tyrka	Identification of candidate genes responsible for chasmogamy in wheat	2023
3	P. Bednarek; A. Dorczyk; T. Drzazga; D. Jasińska; P. Krajewski; B. Ługowska; R. Martofel; P. Matysik; M. Niewińska; D. Ratajczak; K. Rączka; T. Sikora; D. Tyrka; M. Tyrka; E. Witkowski; U. Woźna-Pawlak	Genome-wide association mapping in elite winter wheat breeding for yield improvement	2023
4	A. Bocian; J. Gikunju; K. Hus; J. Kimotho ; J. Legath; E. Manson; K. Mutinda; V. Petrilla	Development of an Inhibition Enzyme-Linked Immunosorbent Assay (ELISA) Prototype for Detecting Cytotoxic Three-Finger Toxins (3FTxs) in African Spitting Cobra Venoms	2022
5	A. Bocian; K. Hus; J. Kimani; J. Kimotho ; M. Kyama; J. Legath; E. Manson; V. Petrilla	Development and Characterization of Anti-Naja ashei Three-Finger Toxins (3FTxs)-Specific Monoclonal Antibodies and Evaluation of Their In Vitro Inhibition Activity	2022
6	M. Dyda; G. Gołębiowska; M. Rapacz; M. Szechyńska-Hebda; M. Tyrka; I. Wąsek; M. Wędzony	Quantitative trait loci and candidate genes associated with freezing tolerance of winter triticale (× Triticosecale Wittmack)	2022
7	M. Dyda; G. Gołębiowska; M. Rapacz; M. Tyrka; M. Wędzony	Genetic mapping of adult-plant resistance genes to powdery mildew in triticale	2022
8	M. Dyda; G. Gołębiowska; M. Rapacz; M. Tyrka; M. Wędzony	Mapping of QTL and candidate genes associated with powdery mildew resistance in triticale (× Triticosecale Wittm.)	2022
9	P. Krajewski; R. Marcinkowski; R. Martofel; P. Matysik; M. Mokrzycka; M. Rakoczy-Trojanowska; M. Rokicki; S. Stojałowski; M. Tyrka; U. Woźna-Pawlak; B. Żmijewska	Genome-Wide Association Analysis for Hybrid Breeding in Wheat	2022
10	A. Barbasz; A. Bocian; A. Czyżowska; B. Dyba; K. Hus; J. Legath; V. Petrilla; M. Petrillova; E. Rudolphi-Szydło	Effects of 3FTx Protein Fraction from Naja ashei Venom on the Model and Native Membranes: Recognition and Implications for the Mechanisms of Toxicity	2021
11	A. Pietrusińska; M. Tyrka	Linkage of Lr55 wheat leaf rust resistance gene with microsatellite and DArT-based markers	2021
12	B. Bakera; P. Krajewski; M. Mokrzycka; M. Rakoczy-Trojanowska; M. Szeliga; M. Święcicka; M. Tyrka	Identification of Rf Genes in Hexaploid Wheat (Triticumaestivum L.) by RNA-Seq and Paralog Analyses	2021
13	B. Bakera; P. Krajewski; P. Matysik; M. Mokrzycka; M. Rakoczy-Trojanowska; M. Rokicki; S. Stojałowski; M. Szeliga; D. Tyrka; M. Tyrka	Evaluation of genetic structure in European wheat cultivars and advanced breeding lines using high-density genotyping-by-sequencing approach	2021
14	J. Buczkowicz; T. Drzazga; B. Ługowska; P. Matysik; K. Rubrycki; M. Semik; D. Tyrka; M. Tyrka; E. Witkowski	Identyfikacja efektywnych genów odporności na wybrane choroby wirusowe i grzybowe pszenicy zwyczajnej	2021
15	J. Buczkowicz; T. Drzazga; G. Fic; M. Jaromin; P. Krajewski; P. Matysik; R. Mazur; P. Milczarski; T. Sikora; M. Szeliga; D. Tyrka; M. Tyrka; E. Witkowski	Selekcja genomowa pszenicy ozimej	2021
16	A. Bocian; J. Buczkowicz; E. Ciszkowicz; K. Hus; K. Lecka-Szlachta; J. Legath; L. Legath; V. Petrilla; M. Petrillova; M. Pietrowska	Antimicrobial Activity of Protein Fraction from Naja ashei Venom Against Staphylococcus epidermidis	2020
17	A. Bocian; J. Buczkowicz; K. Hus; M. Jaromin; J. Legath; D. Łysiak; V. Petrilla; M. Petrillova; S. Sławek	Comparison of Methods for Measuring Protein Concentration in Venom Samples	2020
18	A. Bocian; K. Hus; E. Kuna; J. Legath; A. Lewińska; V. Petrilla; M. Petrillova; M. Wnuk	Evaluation of Antifungal Activity of Naja pallida and Naja mossambica Venoms against Three Candida Species	2020
19	A. Bocian; K. Hus; J. Legath; Ł. Marczak; V. Petrilla; M. Petrillova	Different research approaches in unraveling the venom proteome of Naja ashei	2020
20	E. Ciszkowicz; E. Kaznowska; P. Porzycki; M. Semik; M. Tyrka	MiR-93/miR-375: Diagnostic Potential, Aggressiveness Correlation and Common Target Genes in Prostate Cancer	2020
21	G. Czajowski; M. Karbarz; M. Pojmaj; A. Strzembicka; D. Tyrka; M. Tyrka; A. Wardyńska; M. Wędzony	Quantitative trait loci mapping of adult-plant resistance to powdery mildew in triticale	2020
22	J. Ciura; M. Szeliga; M. Tyrka	Representational Difference Analysis of Transcripts Involved in Jervine Biosynthesis	2020
23	A. Bocian; J. Buczkowicz; K. Hus; M. Jaromin; J. Legath	An effective method of isolating honey proteins	2019
24	J. Ciura; M. Grzesik; M. Szeliga; M. Tyrka	Identification of candidate genes involved in steroidal alkaloids biosynthesis in organ-specific transcriptomes of Veratrum nigrum L.	2019
25	J. Legath; D. Marcincakova; M. Miłek	Polyphenols Content, Antioxidant Activity, and Cytotoxicity Assessment of Taraxacum officinale Extracts Prepared through the Micelle-Mediated Extraction Method	2019
26	M. Dyda; M. Szechyńska-Hebda; M. Tyrka; I. Wąsek; M. Wędzony	Local and systemic regulation of PSII efficiency in triticale infected by the hemibiotrophic pathogen Microdochium nivale	2019
27	M. Dziurka; K. Hura; T. Hura; A. Ostrowska; M. Tyrka	Participation of Wheat and Rye Genome in Drought Induced Senescence in Winter Triticale (X Triticosecale Wittm.)	2019
28	T. Csank; M. Falis; M. Fedorova; K. Hus; J. Legath; S. Marcincak; D. Marcincakova; D. Mudronova; P. Schusterova	Impact of Zinc Sulfate Exposition on Viability, Proliferation and Cell Cycle Distribution of Epithelial Kidney Cells	2019
29	Z. Banaszak; A. Fiust; Z. Nita; W. Orłowska-Job; M. Pojmaj; M. Rapacz; M. Tyrka; M. Wójcik-Jagła	Sposób selekcji mrozoodpornych genotypów jęczmienia ozimego	2019