Cel kształcenia i wykaz literatury

Główny cel kształcenia: Poznanie zasad funkcjonowania systemu przekazywania informacji genetycznej z pokolenia na pokolenie, zasad kontroli procesów biochemicznych i fizjologicznych w komórkach przez geny. Poznanie podstawowych metod stosowanych w badaniach i analizach molekularnych.

Ogólne informacje o zajęciach: Przedmiot realizowany w wymiarze 45 godz. wykładów i 45 godz. ćwiczeń laboratoryjnych (30 godz. wykładów i 30 godz. ćwiczeń w semestrze piątym oraz 15 godz. wykładów i 15 godz. ćwiczeń w semestrze szóstym)

Wykaz literatury, wymaganej do zaliczenia zajęć

Literatura wykorzystywana podczas zajęć wykładowych

1	James D. Watson, Tania A. Baker, Stephen P. Bell	Molecular Biology of the Gene	Pearson.	2013
2	Marcelo L. Larramendy and Sonia Soloneski	Nucleic Acids: From Basic Aspects to Laboratory Tools	ITexli.	2016

Literatura wykorzystywana podczas zajęć ćwiczeniowych/laboratoryjnych/innych

1	Muller	Nucleic Acids from A to Z	2008.	Wiley
2	Westermeier	Electrophoresis in Practice: A Guide to Methods and Applications of DNA and Protein Separations	Viley.	2016

Literatura do samodzielnego studiowania

1

Alexander McLenann, Andy Bates, Mike White, Phil Turner

Krótkie wykłady Biologia molekularna

PWN.

2011

Wymagania wstępne w kategorii wiedzy/umiejętności/kompetencji społecznych

Wymagania formalne: brak

Wymagania wstępne w kategorii Wiedzy: znajomość biologii komórki, genetyki i biochemii

Wymagania wstępne w kategorii Umiejętności: podstawowe umiejętności pracy w laboratorium

Wymagania wstępne w kategorii Kompetencji społecznych: brak

Efekty kształcenia dla zajęć

MEK	Student, który zaliczył zajęcia	Formy zajęć/metody dydaktyczne prowadzące do osiągnięcia danego efektu kształcenia	Metody weryfikacji każdego z wymienionych efektów kształcenia	Związki z KEK	Związki z PRK
01	Zna mechanizmy molekularne kierujące funkcjonowaniem komórek: replikacja, transkrypcja, translacja, naprawa uszkodzeń DNA	wykład, laboratorium	egzamin cz. pisemna, obserwacja wykonawstwa, raport pisemny, zaliczenie cz. praktyczna	K_W05+++ K_W06+++ K_W14+++ K_U06+++ K_U09+ K_K01+++ K_K03+++	P6S_KK P6S_KR P6S_UO P6S_UU P6S_UW P6S_WG
02	Zna podstawowe metody analizy kwasów nukleinowych: izolacja, elektroforeza, cięcie restrykcyjne, ligacja, hybrydyzacja, PCR	wykład laboratoria	egzamin cz. pisemna, obserwacja wykonawstwa, raport pisemny	K_W05+ K_W14+ K_U09+ K_K01+ K_K03+	P6S_KK P6S_KR P6S_UO P6S_UW P6S_WG
03	Zna możliwości praktycznego wykorzystania wiedzy z zakresu biologii molekularnej w biotechnologii przy produkcji leków, kosmetyków, żywności, w analityce medycznej.	wykład, laboratorium	egzamin cz. pisemna	K_W05+ K_W14+ K_K01+ K_K03+	P6S_KK P6S_KR P6S_WG

Uwaga: W zależności od sytuacji epidemicznej, jeżeli nie będzie możliwości weryfikacji osiągniętych efektów uczenia się określonych w programie studiów w sposób stacjonarny w szczególności zaliczenia i egzaminy kończące określone zajęcia będą mogły się odbywać przy użyciu środków komunikacji elektronicznej (w sposób zdalny).

Treści kształcenia dla zajęć

Sem.	TK	Treści kształcenia	Realizowane na	MEK
5	TK01	Podstawowa terminologia z zakresu biologii molekularnej. Różnice pomiędzy organizmami prokariotycznymi i eukariotycznymi w strukturze informacji genetycznej. Wprowadzenie do laboratoriów: wybrane metody izolacji kwasów nukleinowych.	W01-W04	MEK01 MEK02 MEK03
5	TK02	Plazmidy: struktura, replikacja, funkcje biologiczne (przekazywanie informacji genetycznej pomiędzy komórkami, zapewnianie odporności niekorzystne czynniki środowiskowe takie jak antybiotyki, jony metali ciężkich, sulfonamidy, fenol i jego pochodne, wirulencja wzglądem organizmu gospodarza, eliminacja konkurencji za środowiska ). Systematyka plazmidów. Zastosowanie plazmidów w inżynierii genetycznej : plazmidy Ti i Ri, plazmidy bakterii E. coli. Wprowadzenie do laboratoriów: enzymy restrykcyjne (zastosowanie w inżynierii genetycznej), mapa restrykcyjna.	W05-W12	MEK01 MEK02 MEK03
5	TK03	Budowa chromosomu bakteryjnego. Replikacja chromosomu bakteryjnego. Metylacja chromosomu bakteryjnego. Wprowadzenie do laboratoriów: reakcja PCR (skład mieszaniny reakcyjnej, substraty, produkty, warunki fizyczne, startery).	W13-W17	MEK01 MEK02 MEK03
5	TK04	Transkrypcja u prokariotów.	W18-W20	MEK01 MEK02 MEK03
5	TK05	Budowa u funkcja rybosomów prokariotycznych. Translacja w komórkach prokariotycznych. Potranslacyjne modyfikacje białek u prokariotów.	W21-W23	MEK01 MEK02 MEK03
5	TK06	Źródła zmienności u organizmów prokariotycznych.	W24-W25	MEK01 MEK02 MEK03
5	TK07	Kompartmentacja komórek eukariotycznych i jej wpływ na strukturę genomów eukariotycznych.	W26	MEK01 MEK02 MEK03
5	TK08	Budowa chromosomu eukariotycznego: centromer, telomery, euchromatyna, heterochromatyna, nukleosomu, histony. Replikacja chromosomu eukariotycznego.	W27-W30	MEK01
5	TK09	Izolacja plazmidów z bakterii E. coli.	L01-L05	MEK01 MEK02 MEK03
5	TK10	Elektroforeza DNA w żelu agarozowym.	L06-L10	MEK01 MEK02 MEK03
5	TK11	Cięcie DNA enzymami restrykcyjnymi.	L11-L15	MEK01 MEK02 MEK03
5	TK12	Reakcja PCR	L16-L20	MEK01 MEK02 MEK03
5	TK13	Sporządzenie mapy restrykcyjnej, analiza produktów reakcji PCR.	L21-L25	MEK01 MEK02 MEK03
5	TK14	Ligacja DNA.	L26-L30	MEK01 MEK02 MEK03
6	TK01	Rekombinacja genetyczna u eukariontów (rekombinacja homologiczna i niehomologiczna).	W01	MEK01 MEK02 MEK03
6	TK02	Sekwencje powtórzone w genomach eukariotycznych.	W02	MEK01 MEK02 MEK03
6	TK03	Struktura genów eukariotycznych: egzony i introny, promotory.	W03-W05	MEK01 MEK02 MEK03
6	TK04	Transkrypcja w komórkach eukariotycznych.	W06-Wo7	MEK01 MEK02 MEK03
6	TK05	Dojrzewanie mRNA: synteza czapeczki, składanie, poliadenylacja.	W08	MEK01 MEK02 MEK03
6	TK06	Regulacja ekspresji genów eukariotycznych. Interferencja RNA.	W09-W10	MEK01 MEK02 MEK03
6	TK07	Translacja w komórkach eukariotycznych: różnice w stosunku do procesu eukariotycznego, budowa rybosomów eukariotycznych, różnice w odczytywaniu kodu mitochondrialnego.	W11-W12	MEK01 MEK02 MEK03
6	TK08	Budowa genomu mitochondrialnego i plastydowego. Wprowadzenie do laboratoriów: aligacja cząsteczek DNA, hybrydyzacja Southern Blot.	W13-W14	MEK01 MEK02 MEK03
6	TK09	Aktualne problemy i nowe odkrycia w biologii molekularnej.	W15	MEK01 MEK02 MEK03
6	TK10	Analiza produktów ligacji DNA.	L01-L05	MEK01 MEK02 MEK03
6	TK11	Hybrydyzacja Southern Blot	L06-L15	MEK01 MEK02 MEK03

Nakład pracy studenta

Forma zajęć	Praca przed zajęciami	Udział w zajęciach	Praca po zajęciach
Wykład (sem. 5)		Godziny kontaktowe: 30.00 godz./sem.	Uzupełnienie/studiowanie notatek: 10.00 godz./sem. Studiowanie zalecanej literatury: 25.00 godz./sem.
Laboratorium (sem. 5)	Przygotowanie do laboratorium: 1.00 godz./sem.	Godziny kontaktowe: 30.00 godz./sem.	Dokończenia/wykonanie sprawozdania: 6.00 godz./sem.
Konsultacje (sem. 5)	Przygotowanie do konsultacji: 2.00 godz./sem.	Udział w konsultacjach: 1.00 godz./sem.
Egzamin (sem. 5)	Przygotowanie do egzaminu: 25.00 godz./sem.	Egzamin pisemny: 1.00 godz./sem.
Wykład (sem. 6)		Godziny kontaktowe: 15.00 godz./sem.	Uzupełnienie/studiowanie notatek: 2.00 godz./sem. Studiowanie zalecanej literatury: 8.00 godz./sem.
Laboratorium (sem. 6)		Godziny kontaktowe: 15.00 godz./sem.
Konsultacje (sem. 6)	Przygotowanie do konsultacji: 2.00 godz./sem.	Udział w konsultacjach: 1.00 godz./sem.
Zaliczenie (sem. 6)	Przygotowanie do zaliczenia: 10.00 godz./sem.	Zaliczenie pisemne: 1.00 godz./sem.

Sposób wystawiania ocen składowych zajęć i oceny końcowej

Forma zajęć	Sposób wystawiania oceny podsumowującej
Wykład	ocena z egzaminu
Laboratorium	zaliczenie
Ocena końcowa	ocena za egzaminu
Wykład	ocena z zaliczenia
Laboratorium	zaliczenie
Ocena końcowa	ocena za egzaminu

Przykładowe zadania

Wymagane podczas egzaminu/zaliczenia
(-)

Realizowane podczas zajęć ćwiczeniowych/laboratoryjnych/projektowych
Pytania biologia molekularna.pdf

Inne
(-)

Czy podczas egzaminu/zaliczenia student ma możliwość korzystania z materiałów pomocniczych : nie

Treści zajęć powiazane są z prowadzonymi badaniami naukowymi: nie